Az egyik leghosszabb ideig futó sci-fi sorozatnak (éppen pénteken szorult második helyre a Csillagkapu mögött) bőven volt ideje crossoverezni, és tette is bőszen. Scully és Mulder egészen pontosan 6 másik sorozattal kokettált a 9 évad alatt, nézzük a legérdekesebbeket.

Elsőként a COPS című reality sorozatot említjük, minket ez szórakoztatott a legjobban (jó, a Simpsonos crossover is fasza volt), hiszen egy, a mi valóságunkban játszódó sorozatot vontak be az ufós-összeesküvős világba, hozva ezzel a szívbajt az "Elvis mégis él!" fejléceket komolyan vevő rétegre. Az inkriminált epizód úgy kezdődött, mint a FOX rendőrös dokureality műsora, párosunk egy Los Angeles lakóit terrorizáló rém nyomába erednek, és vágnak iszonyú komoly képet a Blair Witch Projecthez hasonló, rángatós kézikamerával felvett képeken.

A Simpsons crossover úgynevezett egyirányú átséta volt, mivel a hús-vér szereplőket még csak-csak lehet animálni, de Homerhez hasonló fejszerkezetű színészt már nem egyszerű találni. Itt a páros azért érkezik Springfieldbe, mert Homer idegen lényt vél látni a városban, de persze kiderül, hogy csak Mr. Burns  az, akinek a fiatalító injekciók fura külsőt kölcsönöztek.

Chris Carter, a sorozat alkotója korszakalkotó crosssovert is abszolvált a sorozattal, mégpedig akkor, amikor a főhőseinket segítő háromtagú csoport, a The Lone Gunmen (később az X-akták spinoffja lett) először tűnt fel a sorozatban. Az epizódban az akkor éppen az X-akták mozifilm forgatásával foglalaskodó Scully-Mulder páros csak másodpercekre tűnik fel, viszont megjelenik Munch nyomozó, az NBC-n akkor éppen futó Homicide című sorozat egyik főszereplője. Miért is volt ez annyira jelentős? Soha addig még nem fordult elő, hogy két különböző csatorna (esetünkben a FOX és az NBC) sorozatai között bármilyen átjárás létre jöhessen. Egy évaddal később tovább bonyolódott a helyzet, mert a Homicide ugyan lekerült a műsorról, de a detektív figurája nem: az Esküdt Ellenségek egyik spinoffjának lett állandó szereplője, és így hivatalosan az X-akták ezzel a sorozattal is crossoverezett.